Bakteria ialah kajian bakteria dan hubungannya dengan ubat. Bakteria berkembang dari pakar perubatan yang perlu menggunakan teori kuman untuk menguji kebimbangan yang berkaitan dengan kerosakan makanan dan wain pada abad ke-19. Pengenalpastian dan pencirian bakteria dikaitkan dengan penyakit menyebabkan kemajuan bakteria patogen. Postulat Koch memainkan peranan untuk mengenal pasti hubungan antara bakteria dan penyakit tertentu. Sejak itu, bakteriologi telah mempunyai banyak kemajuan yang berjaya seperti vaksin yang berkesan, contohnya toksoid difteria dan toksoid tetanus. Terdapat juga beberapa vaksin yang tidak berkesan dan mempunyai kesan sampingan misalnya, vaksin demam kepialu. Bakteria juga menyediakan penemuan antibiotik.